Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGGHGQ32M88 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGGHGQ32M88 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGGHGQ32M88 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms