Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HFEQ30201 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HFEQ30201 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HFEQ30201 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HFEQ30201 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HFEQ30201 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HFEQ30201 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HFEQ30201 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HFEQ30201 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HFEQ30201 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HFEQ30201 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HFEQ30201 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HFEQ30201 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HFEQ30201 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HFEQ30201 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HFEQ30201 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HFEQ30201 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HFEQ30201 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HFEQ30201 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HFEQ30201 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HFEQ30201 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HFEQ30201 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HFEQ30201 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HFEQ30201 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HFEQ30201 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HFEQ30201 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HFEQ30201 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HFEQ30201 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HFEQ30201 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HFEQ30201 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HFEQ30201 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HFEQ30201 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HFEQ30201 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HFEQ30201 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HFEQ30201 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HFEQ30201 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HFEQ30201 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HFEQ30201 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HFEQ30201 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HFEQ30201 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HFEQ30201 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HFEQ30201 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HFEQ30201 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HFEQ30201 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HFEQ30201 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HFEQ30201 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HFEQ30201 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HFEQ30201 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HFEQ30201 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms