Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C15orf59Q2T9L4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C15orf59Q2T9L4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C15orf59Q2T9L4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C15orf59Q2T9L4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms