Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF4Q2M2E3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF4Q2M2E3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF4Q2M2E3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms