Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPP1Q16831 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UPP1Q16831 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPP1Q16831 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPP1Q16831 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPP1Q16831 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 772.8 ms