Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATP2B3Q16720 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATP2B3Q16720 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP2B3Q16720 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP2B3Q16720 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP2B3Q16720 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
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