Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN3Q16667 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN3Q16667 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN3Q16667 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN3Q16667 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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