Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.521e-10■■■■□ 23.1
SRSF7Q16629 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 34.55□□□□□ -1.681e-10■■■■□ 23.1
SRSF7Q16629 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.071e-10■■■■□ 23.1
SRSF7Q16629 PPP4R2-203ENST00000470976 1033 ntTSL 221.89■■□□□ 1.097e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PPP4R2-206ENST00000488810 877 ntTSL 521.34■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PPP4R2-205ENST00000482242 771 ntTSL 320.97■□□□□ 0.957e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-210ENST00000506631 1530 ntTSL 1 (best)19.52■□□□□ 0.727e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-205ENST00000525774 588 ntTSL 418.95■□□□□ 0.627e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-224ENST00000514268 2751 ntTSL 516.09■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 TOX3-205ENST00000568436 548 ntTSL 314.88□□□□□ -0.037e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.177e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 513.96□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-222ENST00000513784 710 ntTSL 213.43□□□□□ -0.267e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.297e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.527e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 511.26□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.657e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 CRYBB2P1-201ENST00000354451 1560 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.847e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 28.81□□□□□ -17e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-207ENST00000532201 597 ntTSL 48.41□□□□□ -1.067e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 58.27□□□□□ -1.097e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 57.92□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 23
SRSF7Q16629 TOX3-203ENST00000563091 572 ntTSL 47.12□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-203ENST00000414841 666 ntTSL 36.29□□□□□ -1.47e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 36.26□□□□□ -1.417e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RGS12-219ENST00000511805 552 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.557e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.667e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 PPP4R2-204ENST00000476505 323 ntTSL 54.17□□□□□ -1.747e-7■■■■□ 23
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-211ENST00000613811 1744 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.694e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.14e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-207ENST00000595773 546 ntTSL 512.99□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-207ENST00000541245 382 ntTSL 312□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-209ENST00000599972 498 ntTSL 211.56□□□□□ -0.564e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-208ENST00000543876 560 ntTSL 411.15□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-205ENST00000538884 540 ntTSL 410.67□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.114e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 AC005614.2-201ENST00000595508 461 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.224e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-202ENST00000414720 2396 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.324e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.684e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 ZNF780A-210ENST00000601688 467 ntTSL 1 (best)2.99□□□□□ -1.934e-6■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 LUC7L-219ENST00000494545 725 ntTSL 517.39■□□□□ 0.374e-7■■■■□ 22.9
SRSF7Q16629 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.827e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.127e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.457e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.629e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.469e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 217.77■□□□□ 0.439e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.199e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.259e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.439e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 55.85□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.539e-7■■■■□ 22.8
SRSF7Q16629 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.047e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.047e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 212.91□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 512.96□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 212.72□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 RBM39-224ENST00000463098 869 ntTSL 212.29□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 RBM39-222ENST00000461849 861 ntTSL 211.21□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 22.7
SRSF7Q16629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.77e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.317e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.767e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.087e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.167e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.247e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.357e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.457e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.467e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.57e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-202ENST00000346198 667 ntTSL 35.42□□□□□ -1.547e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.567e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.647e-7■■■■□ 22.6
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