Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXT1Q16394 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXT1Q16394 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXT1Q16394 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT1Q16394 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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