Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIK4Q16099 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK4Q16099 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK4Q16099 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK4Q16099 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK4Q16099 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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