Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEA2Q15560 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCEA2Q15560 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCEA2Q15560 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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