Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms