Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCM1Q15154 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCM1Q15154 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCM1Q15154 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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