Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC3Q15034 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC3Q15034 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC3Q15034 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC3Q15034 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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