Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCARF1Q14162 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SCARF1Q14162 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCARF1Q14162 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SCARF1Q14162 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
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