Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNC3Q14003 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNC3Q14003 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNC3Q14003 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNC3Q14003 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNC3Q14003 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNC3Q14003 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNC3Q14003 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNC3Q14003 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNC3Q14003 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNC3Q14003 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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