Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1DQ13901 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1DQ13901 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1DQ13901 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1DQ13901 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1DQ13901 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1DQ13901 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1DQ13901 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1DQ13901 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1DQ13901 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1DQ13901 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1DQ13901 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1DQ13901 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1DQ13901 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1DQ13901 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1DQ13901 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1DQ13901 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1DQ13901 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1DQ13901 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1DQ13901 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1DQ13901 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1DQ13901 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1DQ13901 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1DQ13901 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1DQ13901 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1DQ13901 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1DQ13901 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1DQ13901 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1DQ13901 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1DQ13901 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1DQ13901 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1DQ13901 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1DQ13901 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1DQ13901 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1DQ13901 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1DQ13901 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1DQ13901 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1DQ13901 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1DQ13901 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1DQ13901 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1DQ13901 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1DQ13901 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms