Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALCAMQ13740 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALCAMQ13740 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALCAMQ13740 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALCAMQ13740 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALCAMQ13740 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALCAMQ13740 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALCAMQ13740 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALCAMQ13740 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALCAMQ13740 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALCAMQ13740 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALCAMQ13740 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALCAMQ13740 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALCAMQ13740 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALCAMQ13740 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALCAMQ13740 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALCAMQ13740 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALCAMQ13740 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALCAMQ13740 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALCAMQ13740 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALCAMQ13740 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ALCAMQ13740 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALCAMQ13740 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALCAMQ13740 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALCAMQ13740 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALCAMQ13740 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALCAMQ13740 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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