Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A4Q13733 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A4Q13733 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A4Q13733 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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