Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM5Q13571 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAPTM5Q13571 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM5Q13571 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM5Q13571 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms