Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
PKD2Q13563 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PKD2Q13563 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PKD2Q13563 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PKD2Q13563 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
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