Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAPC2Q13487 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAPC2Q13487 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNAPC2Q13487 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNAPC2Q13487 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNAPC2Q13487 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
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