Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRSF6Q13247 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF6Q13247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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