Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECH1Q13011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECH1Q13011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECH1Q13011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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