Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX4Q12846 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX4Q12846 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX4Q12846 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STX4Q12846 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX4Q12846 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX4Q12846 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX4Q12846 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX4Q12846 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX4Q12846 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX4Q12846 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX4Q12846 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX4Q12846 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX4Q12846 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX4Q12846 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX4Q12846 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX4Q12846 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX4Q12846 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STX4Q12846 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX4Q12846 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX4Q12846 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX4Q12846 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STX4Q12846 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX4Q12846 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX4Q12846 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX4Q12846 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX4Q12846 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX4Q12846 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX4Q12846 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX4Q12846 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX4Q12846 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX4Q12846 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX4Q12846 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX4Q12846 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX4Q12846 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX4Q12846 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX4Q12846 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STX4Q12846 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX4Q12846 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX4Q12846 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX4Q12846 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX4Q12846 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX4Q12846 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX4Q12846 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX4Q12846 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX4Q12846 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX4Q12846 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX4Q12846 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX4Q12846 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX4Q12846 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX4Q12846 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX4Q12846 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STX4Q12846 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX4Q12846 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX4Q12846 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX4Q12846 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STX4Q12846 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX4Q12846 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STX4Q12846 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX4Q12846 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX4Q12846 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX4Q12846 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX4Q12846 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STX4Q12846 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX4Q12846 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX4Q12846 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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