Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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