Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC173Q0VFZ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC173Q0VFZ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC173Q0VFZ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC173Q0VFZ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms