Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUDPQ08623 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUDPQ08623 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUDPQ08623 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms