Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFF3Q07654 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFF3Q07654 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFF3Q07654 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFF3Q07654 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms