Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YBL111CYBL111C 2004 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 TPI1YDR050C 747 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 YJL043WYJL043W 774 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 SNF7YLR025W 723 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 HNM1YGL077C 1692 nt6.74□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 CKI1YLR133W 1749 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 HRA1HRA1 564 nt6.73□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 BAP3YDR046C 1815 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 YHR033WYHR033W 1272 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 ERV25YML012W 636 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 RPS6AYPL090C 711 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 RPS6BYBR181C 711 nt6.72□□□□□ -1.33
SSK1Q07084 GRH1YDR517W 1119 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 UTR5YEL035C 501 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 BUD20YLR074C 501 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 APT1YML022W 564 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YTH1YPR107C 627 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 RTC2YBR147W 891 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 CAN1YEL063C 1773 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 MSS51YLR203C 1311 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 FLC2YAL053W 2352 nt6.71□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 PRY2YKR013W 990 nt6.7□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 CAR2YLR438W 1275 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YOR343CYOR343C 327 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 ADA2YDR448W 1305 nt6.69□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 RFS1YBR052C 633 nt6.68□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YPC1YBR183W 951 nt6.68□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 MLS1YNL117W 1665 nt6.68□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YGL260WYGL260W 231 nt6.67□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.67□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 FAF1YIL019W 1041 nt6.67□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YDR327WYDR327W 327 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 YAH1YPL252C 519 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 ENB1YOL158C 1821 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 STE3YKL178C 1413 nt6.66□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 NUP84YDL116W 2181 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 HEL1YKR017C 1656 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 MRP1YDR347W 966 nt6.65□□□□□ -1.34
SSK1Q07084 CMK2YOL016C 1344 nt6.65□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 DAL80YKR034W 810 nt6.64□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YNL295WYNL295W 1575 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 GDH1YOR375C 1365 nt6.63□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 ELP4YPL101W 1371 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 SNF4YGL115W 969 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 AIM2YAL049C 741 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 MFT1YML062C 1179 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YMR206WYMR206W 942 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 PPS1YBR276C 2424 nt6.62□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 FCY2YER056C 1602 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 ECM27YJR106W 2178 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YPR084WYPR084W 1371 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 KDX1YKL161C 1302 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 BDS1YOL164W 1941 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 TAD2YJL035C 753 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YKL147CYKL147C 618 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 LIP5YOR196C 1245 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YCR061WYCR061W 1896 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 SMC5YOL034W 3282 nt6.61□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.6□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 ADH6YMR318C 1083 nt6.6□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 AFG3YER017C 2286 nt6.6□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 ICL2YPR006C 1728 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 EDC3YEL015W 1656 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 RRP43YCR035C 1185 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 OPI1YHL020C 1215 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.59□□□□□ -1.35
SSK1Q07084 CBK1YNL161W 2271 nt6.59□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 NUP57YGR119C 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 YCR041WYCR041W 333 nt6.58□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 TRR1YDR353W 960 nt6.58□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 LOT6YLR011W 576 nt6.58□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 YIL168WYIL168W 384 nt6.57□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 ADE1YAR015W 921 nt6.57□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 PUS5YLR165C 765 nt6.57□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 YOR012WYOR012W 414 nt6.57□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 SRF1YDL133W 1314 nt6.56□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 ERG24YNL280C 1317 nt6.56□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 YOR389WYOR389W 1875 nt6.56□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 LCP5YER127W 1074 nt6.56□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 MGM101YJR144W 810 nt6.56□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 IDP3YNL009W 1263 nt6.56□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 CRN1YLR429W 1956 nt6.55□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 URH1YDR400W 1023 nt6.55□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 EDC2YER035W 438 nt6.55□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 INP54YOL065C 1155 nt6.55□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 CDC3YLR314C 1563 nt6.55□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 SSC1YJR045C 1965 nt6.55□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 ATG22YCL038C 1587 nt6.54□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 PPZ2YDR436W 2133 nt6.54□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 TDH1YJL052W 999 nt6.54□□□□□ -1.36
SSK1Q07084 YLR112WYLR112W 420 nt6.53□□□□□ -1.36
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