Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL18Q07020 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL18Q07020 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL18Q07020 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms