Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FMODQ06828 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FMODQ06828 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FMODQ06828 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FMODQ06828 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FMODQ06828 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FMODQ06828 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FMODQ06828 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FMODQ06828 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FMODQ06828 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FMODQ06828 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FMODQ06828 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FMODQ06828 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FMODQ06828 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FMODQ06828 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FMODQ06828 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FMODQ06828 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FMODQ06828 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FMODQ06828 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FMODQ06828 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMODQ06828 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMODQ06828 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMODQ06828 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FMODQ06828 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMODQ06828 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMODQ06828 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMODQ06828 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FMODQ06828 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMODQ06828 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMODQ06828 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMODQ06828 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FMODQ06828 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FMODQ06828 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FMODQ06828 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms