Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT17Q04695 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT17Q04695 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT17Q04695 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms