Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TFF2Q03403 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFF2Q03403 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms