Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPCQ03188 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPCQ03188 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CENPCQ03188 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms