Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAX2Q02962 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAX2Q02962 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAX2Q02962 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms