Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.494e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SPON2-210ENST00000506266 462 ntTSL 416.66■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 516.66■□□□□ 0.264e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 316.37■□□□□ 0.214e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 511.31□□□□□ -0.64e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.144e-8■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 325.73■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 525.4■■□□□ 1.662e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.122e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 12e-7■■■■□ 22.6
FKBP4Q02790 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.088e-7■■■■□ 22.5
FKBP4Q02790 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.258e-7■■■■□ 22.5
FKBP4Q02790 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 222.49■■□□□ 1.198e-7■■■■□ 22.5
FKBP4Q02790 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 317.21■□□□□ 0.358e-7■■■■□ 22.5
FKBP4Q02790 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 326.46■■□□□ 1.832e-9■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 522.6■■□□□ 1.212e-9■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.382e-9■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-9■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 513.32□□□□□ -0.282e-9■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)20.64■□□□□ 0.893e-6■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-8■■■■□ 22.4
FKBP4Q02790 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 225.2■■□□□ 1.624e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 523.19■■□□□ 1.34e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.094e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 LZTS2-203ENST00000426584 816 ntTSL 321.18■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 LZTS2-206ENST00000481129 745 ntTSL 318.29■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 321.48■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 317.04■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 22.3
FKBP4Q02790 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 529.17■■■□□ 2.262e-7■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 222.73■■□□□ 1.233e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 315.62■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 58.7□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)5.39□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 35.12□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 54.77□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-7■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.342e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 219.28■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 BCAR1-215ENST00000564028 558 ntTSL 421■□□□□ 0.956e-7■■■■□ 22.2
FKBP4Q02790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-6■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -14e-6■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.59□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-7■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.57e-7■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 228.15■■■□□ 2.17e-7■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 EXOC3L4-206ENST00000560304 657 ntTSL 326.52■■□□□ 1.847e-7■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 EXOC3L4-204ENST00000559693 813 ntTSL 321.81■■□□□ 1.087e-7■■■■□ 22.1
FKBP4Q02790 TCEA2-213ENST00000475792 655 ntTSL 222.72■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 22
FKBP4Q02790 BCAR1-222ENST00000569340 714 ntTSL 316.97■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 22
FKBP4Q02790 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.297e-7■■■■□ 22
FKBP4Q02790 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.127e-7■■■■□ 22
FKBP4Q02790 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.938e-7■■■■□ 22
FKBP4Q02790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.652e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 CDC34-205ENST00000606065 1062 ntTSL 528.92■■■□□ 2.222e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 CDC34-206ENST00000606400 899 ntTSL 223.26■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 CDC34-202ENST00000586283 1147 ntTSL 322.77■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 CDC34-207ENST00000607527 357 ntTSL 518.19■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 BCAR1-217ENST00000566465 547 ntTSL 419.72■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 ZDHHC8-204ENST00000436518 557 ntTSL 419.66■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 318.76■□□□□ 0.597e-7■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.217e-7■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.436e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.436e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.436e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-202ENST00000415933 863 ntTSL 212.83□□□□□ -0.366e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-205ENST00000479021 552 ntTSL 412.63□□□□□ -0.396e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.816e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.876e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 PPIA-207ENST00000481437 570 ntTSL 29.6□□□□□ -0.876e-8■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.012e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.852e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 325.47■■□□□ 1.672e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 21.9
FKBP4Q02790 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 523.2■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 21.8
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 141.6 ms