Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNC1Q01954 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNC1Q01954 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BNC1Q01954 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms