Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFITM3Q01628 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFITM3Q01628 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFITM3Q01628 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFITM3Q01628 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFITM3Q01628 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFITM3Q01628 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms