Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MDM2Q00987 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MDM2Q00987 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MDM2Q00987 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms