Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSG4Q00888 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSG4Q00888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSG4Q00888 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms