Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDK16Q00536 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK16Q00536 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK16Q00536 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms