Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMAD3P84022 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SMAD3P84022 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMAD3P84022 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD3P84022 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD3P84022 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD3P84022 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMAD3P84022 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD3P84022 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMAD3P84022 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD3P84022 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD3P84022 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMAD3P84022 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMAD3P84022 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD3P84022 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMAD3P84022 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMAD3P84022 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMAD3P84022 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMAD3P84022 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMAD3P84022 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMAD3P84022 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMAD3P84022 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD3P84022 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD3P84022 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD3P84022 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD3P84022 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMAD3P84022 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMAD3P84022 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms