Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP1AP78559 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP1AP78559 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP1AP78559 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MAP1AP78559 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MAP1AP78559 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP1AP78559 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP1AP78559 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP1AP78559 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP1AP78559 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP1AP78559 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAP1AP78559 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP1AP78559 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP1AP78559 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP1AP78559 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP1AP78559 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP1AP78559 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP1AP78559 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP1AP78559 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP1AP78559 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP1AP78559 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP1AP78559 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms