Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RELNP78509 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RELNP78509 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELNP78509 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RELNP78509 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RELNP78509 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RELNP78509 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RELNP78509 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELNP78509 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELNP78509 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELNP78509 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RELNP78509 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELNP78509 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RELNP78509 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RELNP78509 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELNP78509 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RELNP78509 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RELNP78509 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RELNP78509 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELNP78509 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RELNP78509 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELNP78509 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELNP78509 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELNP78509 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RELNP78509 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELNP78509 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELNP78509 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELNP78509 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELNP78509 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELNP78509 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELNP78509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELNP78509 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELNP78509 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELNP78509 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELNP78509 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELNP78509 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RELNP78509 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RELNP78509 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELNP78509 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELNP78509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELNP78509 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELNP78509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RELNP78509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RELNP78509 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RELNP78509 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RELNP78509 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RELNP78509 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RELNP78509 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RELNP78509 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELNP78509 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELNP78509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RELNP78509 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RELNP78509 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELNP78509 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELNP78509 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RELNP78509 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELNP78509 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELNP78509 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELNP78509 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELNP78509 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELNP78509 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RELNP78509 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELNP78509 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELNP78509 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELNP78509 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms