Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC6P62333 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMC6P62333 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PSMC6P62333 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSMC6P62333 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMC6P62333 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMC6P62333 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC6P62333 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms