Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P61574 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms