Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS3AP61247 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS3AP61247 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS3AP61247 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms