Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVFC1P60507 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVFC1P60507 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVFC1P60507 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVFC1P60507 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVFC1P60507 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVFC1P60507 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVFC1P60507 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERVFC1P60507 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms