Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX4P57082 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX4P57082 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX4P57082 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX4P57082 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX4P57082 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX4P57082 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX4P57082 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX4P57082 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX4P57082 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX4P57082 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TBX4P57082 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TBX4P57082 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX4P57082 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX4P57082 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX4P57082 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX4P57082 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX4P57082 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX4P57082 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX4P57082 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX4P57082 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX4P57082 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX4P57082 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBX4P57082 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBX4P57082 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBX4P57082 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX4P57082 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX4P57082 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX4P57082 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX4P57082 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX4P57082 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX4P57082 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX4P57082 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX4P57082 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TBX4P57082 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX4P57082 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX4P57082 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX4P57082 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX4P57082 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX4P57082 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX4P57082 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX4P57082 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBX4P57082 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBX4P57082 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBX4P57082 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBX4P57082 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBX4P57082 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBX4P57082 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBX4P57082 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBX4P57082 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBX4P57082 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBX4P57082 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBX4P57082 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX4P57082 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX4P57082 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX4P57082 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBX4P57082 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBX4P57082 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBX4P57082 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBX4P57082 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBX4P57082 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBX4P57082 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBX4P57082 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBX4P57082 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBX4P57082 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBX4P57082 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms